MSc in Bioinformatics for Computational Genomics Politecnico di Milano

De Master Degree ("Laurea Magistrale") in "Bioinformatics for Computational Genomic s" is een gezamenlijk initiatief van de Universiteit van Milaan en de Politecnico di Milano , en wordt geactiveerd vanaf het academische jaar 2019-2020.

Over het algemeen is het gericht op het vormen van "genome data scientists" , dat wil zeggen afgestudeerden die voldoende kennis hebben over de moleculaire basis van biologische systemen; de structuur en functie van biologische moleculen en hoe ze deelnemen aan cellulaire processen; de technologieën en platforms voor de analyse van genomen; de tools voor bioinformatica en genomische analyse; en de statistische en computationele methodologieën voor de analyse van biomoleculaire gegevens.

De toelating staat open voor alle studenten met een bachelordiploma ("Laurea Triennale"), hetzij in de biologie of biotechnologie of soortgelijke OR computerwetenschappen, techniek, wiskunde of natuurkunde.

Door deel te nemen aan de cursussen die worden gegeven in de BCG-graad, leer je over:

1. De organisatie van informatie in het genoom en de moleculaire en cellulaire processen die ten grondslag liggen aan genexpressie en de regulering ervan.
2. De experimentele methoden die worden gebruikt voor het bestuderen van genen en hun functie in verschillende modelsoorten, zowel prokaryoot als eukaryoot.
3. De technologieën die worden gebruikt in modern genomisch en epigenomisch onderzoek, zoals op sequencing gebaseerde assays van de volgende generatie (genoom- en exoomsequentiebepaling, RNA-sequentiebepaling, ChIP-Seq, enzovoort).
4. Methoden en protocollen voor bioinformatische analyse in functionele genomica-onderzoeken (genoom- en exoomsequentiebepaling, RNA-sequentiebepaling, ChIP-Seq, enzovoort).
5. De algoritmische, wiskundige en statistische benaderingen die ten grondslag liggen aan bio-informatica en genomische analyse-instrumenten.
6. Databasetechnologieën voor de opslag en organisatie van de gegevens.
7. Modellering- en analysetechnieken die in de systeembiologie worden gebruikt voor de studie van interacties in complexe biologische systemen.

Het programma omvat, als een fundamentele stap in de vorming van de studenten, een stage in onderzoekslaboratoria, hetzij aan de universiteit van Milaan, de Politecnico, hetzij in andere Italiaanse of buitenlandse onderzoeksinstituten. De onderzoekservaring van de stage en de resultaten ervan zullen worden beschreven in een afsluitend schriftelijk proefschrift dat voor een thesiscommissie zal worden besproken.

Missie en doelen

De gezamenlijke masteropleiding "Bioinformatics for Computational Genomics" (BCG) van Politecnico di Milano en Università Degli Studi di Milano heeft tot doel de afgestudeerden een adequate kennis te geven over de moleculaire basis van biologische systemen; de structuur en functie van biologische moleculen en hoe ze deelnemen aan cellulaire processen; de technologieën en platforms voor de analyse van genomen; de tools voor bio-informatica en genomische analyse; en de statistische en computationele methodologieën voor de analyse van biomoleculaire gegevens.

Daarom omvat de BCG-graad activiteiten die diepgaande kennis bieden over:

• De organisatie van informatie in het genoom en de moleculaire en cellulaire processen die ten grondslag liggen aan genexpressie en de regulering ervan.
• De experimentele methoden die worden gebruikt voor het bestuderen van genen en hun functie in verschillende modelsoorten, zowel prokaryoot als eukaryoot.
• De technologieën die worden gebruikt in modern genomisch onderzoek.
• Methoden en protocollen voor bioinformatische analyse in functionele genomica-onderzoeken.
• Algoritmische, wiskundige en statistische benaderingen die ten grondslag liggen aan bio-informatica en genomische analyse-instrumenten.
• Databasetechnologieën voor de opslag en organisatie van de gegevens.
• Modellering- en analysetechnieken die in de systeembiologie worden gebruikt voor de studie van interacties in complexe biologische systemen.

vakken

Università Degli Studi di Milano zal de cursussen aanbieden die gericht zijn op biologische onderwerpen, terwijl Politecnico di Milano de computationele cursussen zal aanbieden.

1ste jaar

1e semester

• Verplichte vakken: organische chemie; Bioinformatica en computerbiologie
• Keuzevakken: genetica, cellulaire en moleculaire biologie; Biochemie; Programmering en databanken; Statistieken

2de semester

• Verplichte vakken: Genomics and Transcriptomics; Wetenschappelijke programmering; Machine learning; Biostatistiek

2e jaar

1e semester

• Verplichte vakken: Advanced Genomics and Epigenomics; Structurele chemie; Systeembiologie en netwerkanalyse
• Keuzevakken: interdisciplinair project; Genomisch Big Data Management en Computing

Carrièremogelijkheden

De BCG-master heeft tot doel "datawetenschappers" op te leiden, zeer bekwame professionals die in staat zijn om diepgaande kennis over de moleculaire grondslagen van de levenswetenschappen samen te voegen met up-to-date kennis van de huidige technieken en technologieën voor bio-informatica en genomische analyse. Bijzondere nadruk zal worden gelegd op de kwantitatieve en computationele aspecten van de latere, die gericht zullen zijn op de analyse, modellering en begrip van biologische systemen. Het uiteindelijke doel is om professionals op te leiden in een multidisciplinaire context die klaar zijn om het hoofd te bieden aan de uitdagingen die voortvloeien uit de moderne biomoleculaire wetenschappen in het postgenomische tijdperk, en in staat zijn om kennis over biologie, genetica, informatica, informatietechniek en kennis te vervoegen en te integreren. statistieken op verschillende gebieden van fundamenteel of toegepast onderzoek.

Afgestudeerden in BCG kunnen dus:

• Neem deel aan het ontwerp en de uitvoering van grootschalige genomische analyses.
• Identificeer en haal de biologische betekenis uit de verkregen resultaten.
• Ontwerptools en protocollen voor de bioinformatische analyse van verschillende soorten experimentele data autonoom.
• Speel een centrale rol in onderzoeksgroepen die zich richten op fundamenteel of toegepast genomisch onderzoek.
• Coördineren en begeleiden van onderzoeksprojecten en groepen gericht op bioinformatica en genomics.

Toelating

De vereiste om toegang te krijgen tot de BCG-masteropleiding is een bachelordiploma ("Laurea Triennale") met voldoende kennis van ofwel (1) genetica, moleculaire biologie en biochemie of (2) informatica, informatietechniek en wiskunde. Ook is kennis van de Engelse taal vereist, zoals hieronder gespecificeerd. Studenten die hun bachelordiploma nog niet hebben afgerond, kunnen zich aanmelden als ze voor 31 oktober 2019 willen afstuderen (zie hieronder).

Voor het academische jaar 2019-2020 worden maximaal 50 studenten toegelaten tot het programma , geselecteerd op basis van hun achtergrondkennis en een persoonlijk interview.

Toelatingseisen

Toelatingsvoorwaarden voor Italiaanse studenten

Italiaanse studenten kunnen een aanvraag indienen bij de BCG Masteropleiding, mits ze voldoen aan een van de volgende twee vereisten:

• Ze hebben een bacheloropleiding (Laurea Triennale) afgerond in een van de volgende klassen:
  • Biotechnologie (klasse L2)
  • Biologie (klasse L13)
  • Landbouw en voedingswetenschappen (klasse L26)
  • Farmacologische wetenschappen (klasse L29)

en tijdens hun studies hebben ze ten minste 30 CFU in biologische gebieden (SSD BIO) met ten minste 18 CFU in Genetica (BIO / 18), Molecular Biology (BIO / 11) en Biochemistry (BIO / 10) verworven

OF

• Ze hebben een bacheloropleiding (Laurea Triennale) afgerond in een van de volgende klassen:
  • Informatietechniek (klasse L8)
  • Computerwetenschappen (klasse L31)
  • Fysica (klasse L30)
  • Wiskunde (klasse L35)

en tijdens hun studie hebben ze ten minste 30 CFU verworven op het gebied van informatica, informatica, biomedische technologie, wiskunde en / of statistiek (SSD INF / 01, ING-INF / 05, ING-INF / 06, MAT / 01 -09 en / of SECS-S / 01), met ten minste 6 CFU in wiskunde (MAT / 01-09) en ten minste 12 CFU in een of meer van de volgende gebieden: informatica (INF / 01), informatie engineering (ING-INF / 05), biomedische engineering (ING-INF / 06), statistiek (SECS-S / 01).

Dezelfde criteria worden toegepast op kandidaten die in het bezit zijn van buitenlandse universitaire graden die geschikt worden geacht door de Lerarenraad, waarin het mogelijk is om disciplines en het aantal behaalde studiepunten voor elke discipline duidelijk te identificeren. Als dit niet mogelijk is, zullen de documenten die de loopbaan van de kandidaten certificeren door de raad van docenten in detail worden onderzocht om te beoordelen of hun achtergrond voldoet aan de vorige vereisten.

Niet-gegradueerde studenten kunnen zich aanmelden, maar moeten hun bachelordiploma (Laurea Triennale) behalen voor 31 oktober 2019.

Toelatingsvoorwaarden voor buitenlandse studenten

• Studenten die in het bezit zijn van een bachelordiploma in een gebied dat is beschreven in het vorige punt (Vereisten voor Italiaanse studenten), waar cursussen die in de vereiste disciplines worden gevolgd, duidelijk kunnen worden geïdentificeerd samen met het aantal uren / studiepunten van de cursussen. Als dit niet mogelijk is, worden de documenten die de loopbaan van de studenten certificeren, onderzocht door de Lerarenraad om te beoordelen of hun achtergrond voldoet aan de vorige vereisten.

Taalvereisten

• Studenten moeten bekwaam zijn in het Engels, met een B2-competentieniveau. Studenten die al zijn ingeschreven aan de Universiteit van Milaan, die geen B2-certificaat of gelijkwaardig hebben, worden uitgenodigd om een plaatsingstest af te leggen om hun competentieniveau te bewijzen en dit tijdens het interview te bewijzen. In uitzonderlijke gevallen kunnen studenten zonder B2-plaatsingstoets worden geaccepteerd op voorwaarde dat hun niveau van Engelse taalvaardigheid, beoordeeld tijdens het interview, duidelijk goed is.
• Kennis van het Italiaans is niet vereist voor deelname. Echter, zoals vereist door regelgeving, zullen buitenlandse studenten moeten aantonen basiskennis van de Italiaanse taal te hebben verworven voor het eindversie.

Selectie en ranking

Studenten die aan bovenstaande voorwaarden voldoen, worden toegelaten tot een interview met leden van de Teaching Board voor de beoordeling van hun wetenschappelijke achtergrondkennis.

De adequate persoonlijke voorbereiding van de kandidaten (in hun achtergrondonderwerpen), hun vermogen om in het Engels te communiceren en hun motivatie zijn doorslaggevend voor de toelating. Het interview evalueert de expertise van de kandidaat in onderwerpen die verband houden met hun bachelordiploma.

De commissie beoordeelt elke aanvrager op een schaal van 100 punten:

• Maximaal 50/100 punten worden toegekend voor het CV van de aanvrager (het type bachelordiploma dat wordt gevolgd, examencijfers, bijgewoonde cursussen, extra graden, enz.)
• Maximaal 50/100 punten worden toegekend voor het interview.

De minimale score vereist voor toelating is 60/100.

Voor het academiejaar 2019-2020 vinden op 16 juli 2019 om 9.30 uur interviews plaats voor Italiaanse studenten en buitenlandse studenten die in Italië wonen bij de afdeling Biowetenschappen, Via Celoria 26.

Buitenlandse aanvragers die niet in Italië wonen en hun bachelordiploma in het buitenland hebben behaald, kunnen kiezen voor een online interview. Aan het begin van het interview moeten studenten een geldige identiteitskaart of paspoort tonen voor identificatie.

Inschrijven na toelating

Nadat de resultaten zijn gepubliceerd, moeten studenten die de eerste 50 plaatsen in de ranglijst van verdiensten bezetten hun inschrijving voltooien binnen de termijn die is vermeld in de aankondiging van het vergelijkend onderzoek. Als vervolgens na de initiële deadline de eerste 50 beschikbare plaatsen niet verzadigd zijn, is inschrijving mogelijk voor studenten met een lagere rangorde van verdiensten, op voorwaarde dat ze ten minste 60/100 hebben behaald in de toelatingstoets. Inschrijving van niet-gegradueerden wordt alleen gevalideerd als ze hun bachelordiploma (Laurea Triennale voor Italiaanse studenten) behalen voor 31 oktober 2019. Studenten van andere universiteiten moeten na hun afstuderen op 31 oktober 2019 een certificaat van het toegekende diploma voorleggen aan de Segreteria Studenti.

Onderwerpen

Università Degli Studi di Milano zal de cursussen aanbieden die zijn gericht op biologische onderwerpen, terwijl Politecnico di Milano de computationele cursussen zal aanbieden.

1ste jaar

1e semester

• Verplichte vakken: Organische Chemie; Bio-informatica en computationele biologie
• Keuzevakken: genetica, cellulaire en moleculaire biologie; Biochemie; Programmering en databases; Statistieken

2e semester

• Verplichte vakken: Genomics en Transcriptomics; wetenschappelijke programmering; machinaal leren; Biostatistieken

2e jaar

1e semester

• Verplichte vakken: Advanced Genomics en Epigenomics; structurele chemie; Systeembiologie en netwerkanalyse
• Keuzevakken: Interdisciplinair project; Genomisch big data-beheer en computing

Door het volgen van de cursussen die in de BCG-graad worden gegeven, leert u over:

1. De organisatie van informatie in het genoom en de moleculaire en cellulaire processen die aan de basis liggen van genexpressie en de regulatie ervan.
2. De experimentele methoden die worden gebruikt voor het bestuderen van genen en hun functie in verschillende modelsoorten, zowel prokaryotisch als eukaryoot.
3. De technologieën die worden gebruikt in modern genomisch en epigenomisch onderzoek, zoals op sequencing gebaseerde testen van de volgende generatie (genoom- en exoomsequencing, RNA-sequencing, ChIP-Seq, enzovoort).
4. Methoden en protocollen van bio-informatische analyse in functionele genomics-onderzoeken (genoom- en exoom-sequencing, RNA-sequencing, ChIP-Seq, enzovoort).
5. De algoritmische, wiskundige en statistische benaderingen die ten grondslag liggen aan bio-informatica en genomische analysetools.
6. Databasetechnologieën voor de opslag en organisatie van de gegevens.
7. Modellerings- en analysetechnieken gebruikt in de systeembiologie voor de studie van interacties in complexe biologische systemen.

Het programma omvat, als fundamentele stap in de vorming van de studenten, een stage in onderzoekslaboratoria aan de Universiteit van Milaan, de Politecnico of in andere Italiaanse of buitenlandse onderzoeksinstituten. De onderzoekservaring van de stage en de resultaten ervan zullen worden beschreven in een definitieve schriftelijke dissertatie, die zal worden besproken voor een scriptiecommissie.

De BCG-masteropleiding heeft tot doel "datawetenschappers" op te leiden, zeer bekwame professionals die in staat zijn diepgaande kennis over de moleculaire fundamenten van life sciences te combineren met actuele kennis van de huidige technieken en technologieën voor bio-informatica en genomische analyse. Bijzondere nadruk zal worden gelegd op de kwantitatieve en computationele aspecten van de latere, die gericht zullen zijn op de analyse, modellering en begrip van biologische systemen. Het uiteindelijke doel is om in een multidisciplinaire context professionals op te leiden die klaar zijn om de uitdagingen aan te gaan die voortvloeien uit de moderne biomoleculaire wetenschappen in het post-genomische tijdperk, en in staat zijn om kennis over biologie, genetica, informatica, informatietechnologie en statistieken op verschillende gebieden van fundamenteel of toegepast onderzoek.

Afgestudeerden in BCG zullen dus in staat zijn om:

• Neem deel aan het ontwerp en de uitvoering van grootschalige genomische analyses.
• Identificeer en haal de biologische betekenis uit de verkregen resultaten.
• Ontwerp tools en protocollen voor de bioinformatische analyse van verschillende soorten experimentele data autonoom.
• Een spilfunctie spelen in onderzoeksgroepen gericht op fundamenteel of toegepast genomisch onderzoek.
• Coördineren en begeleiden van onderzoeksprojecten en groepen gericht op bioinformatica en genomics.